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BD Rhapsody 助力單細胞測序研究

更新時(shí)間:2021-07-13

閱讀:1464

 單細胞測序技術(shù)自2009年問(wèn)世,2013年被Nature Methods評為年度技術(shù)以來(lái),越來(lái)越多地被應用在科研領(lǐng)域。自此,單細胞測序技術(shù)被廣泛應用于基礎科研和臨床研究。

   單細胞在許多領(lǐng)域都占有一席之地,對于癌癥早期的診斷、追蹤以及個(gè)體化治療具有重要意義。

 

 

 

 

基本原理

 

 

   單細胞測序首先不是僅僅對一個(gè)細胞進(jìn)行測序,而是說(shuō)該項技術(shù)能對單一細胞的基因組或轉錄組進(jìn)行測序,可以理解為單細胞水平上的測序。

   為什么要進(jìn)行單細胞測序?世界上沒(méi)有兩片相同的葉子,對于多細胞生物來(lái)說(shuō)細胞與細胞之間是存在差異的,很多時(shí)候是基因組、轉錄組上的失之毫厘,功能上的差之千里。比如在腫瘤組織中,腫塊中心的細胞與腫塊周?chē)募毎?,原發(fā)灶與轉移灶的細胞,其基因組與轉錄組等遺傳信息是存在差異的,這也就導致不同腫瘤細胞表現出免疫特性、生長(cháng)速度、侵襲能力等表型方面的差異,最終導致對不同抗腫瘤藥物的敏感性不同或放療敏感性的差異。
   傳統測序方法所展示的信息也是在多細胞水平上的平均信息,而單細胞水平上的測序則*可以反應同一個(gè)細胞群里不同細胞的基因組和轉錄組狀況。單細胞測序技術(shù)的出現,使得從混雜的樣品中篩選出異質(zhì)性信息的難題得以解決,該技術(shù)的成熟使用也必將生命科學(xué)研究向前邁進(jìn)一大步

 

 

 

 

BD Rhapsody

 
 

   BD Rhapsody™單細胞分析系統應運而生,此系統的誕生基于 BD 在細胞生物學(xué)領(lǐng)域 40年的專(zhuān)業(yè)技術(shù),克服了傳統檢測的局限性,能夠對成千上萬(wàn)個(gè)單細胞的數百個(gè)表達基因同時(shí)進(jìn)行數字定量,每個(gè)細胞提取獨立數據,體現異質(zhì)性,可以鑒定和表征新型和罕見(jiàn)細胞類(lèi)型,有助于理解從免疫學(xué)到腫瘤學(xué)等多個(gè)領(lǐng)域內的生物學(xué)過(guò)程。

 

  BD重磅推出的Rhapsody™單細胞分析系統克服了傳統檢測的局限性,如微陣列和大量細胞 RNAseq,傳統檢測依賴(lài)于對多個(gè)細胞的平均檢測,來(lái)實(shí)現對細胞間微妙差異的觀(guān)察。與其他單細胞分析系統相比,BD Rhapsody™的特點(diǎn)及優(yōu)勢在于:

 

1.更高的采樣靈敏度

靶向分析方法有助于提高單細胞測序效率,Rhapsody系統提供的檢測試劑盒(panel)可穩定的重現細胞異質(zhì)性的數據,可用于探索與眾多應用相關(guān)的細胞類(lèi)型。且與全轉錄組擴增的mRNA分析相比,Rhapsody系統對罕見(jiàn)轉錄有更低的檢測閾值。

 

2.克服 PCR 偏差 — BD分子標簽

當對序列讀取進(jìn)行計數時(shí),PCR 擴增偏差可導致基因定量不準確。Rhapsody采用“分子標簽”技術(shù),能為單細胞中每個(gè)轉錄本標記特異性分子標簽,實(shí)現了單細胞水平上基因表達譜的絕對定量,同時(shí),每個(gè)細胞也會(huì )被標記特異性細胞標簽,這使高通量平行建庫成為可能。

 

3.單細胞成像系統

對單細胞分離過(guò)程進(jìn)行質(zhì)控,監控細胞存活率、單細胞分離效率,有效保證實(shí)驗成功率。

 

4.更高的轉錄本檢測特異性

系統通過(guò)*的數據分析流程,去除PCR錯誤擴增產(chǎn)物,降低細胞非特異性表達水平。

 

5.更高的分辨率

可以分辨更細分、微觀(guān)的細胞群和細胞亞種群。

 

6.更經(jīng)濟的測序和設備預算

結合Rhapsody*的單細胞分離技術(shù),單次實(shí)驗可制備100-10000個(gè)單細胞文庫,用戶(hù)可根據需求定制引物,將檢測范圍集中在目標基因,大幅降低后續測序成本。

 

 

   隨著(zhù)人們逐漸意識到單細胞研究對認識人自身以及疾病的重要性,單細胞測序技術(shù)的誕生恰逢其時(shí)。目前單細胞測序已經(jīng)廣泛用于微生物學(xué)、神經(jīng)學(xué)、人體發(fā)育、免疫、癌癥、輔助生殖等領(lǐng)域的研究。相信此次BD Rhapsody單細胞分析系統的閃亮登場(chǎng),能夠為目前高速發(fā)展中的精準醫學(xué)帶來(lái)濃墨重彩的一筆。

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